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Miguel Ángel Prado Rodríguez

Miguel A. Prado es licenciado en Bioquímica y doctor en Ciencias por Universidad de Oviedo. Durante su etapa predoctoral estudió como se modifica de manera específica el fosfoproteoma de la mitosis tras tratamiento con diversos agentes anti-mitóticos utilizados en quimioterapia. Tras diversas estancias en University College London (UCL) y Harvard Medical School (HMS) se especializó en métodos de proteómica cuantitativa basados en cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (LC/MS).

En 2012 comenzó sus estudios postdoctorales en Harvard Medical School como investigador postdoctoral compartido en los laboratorios de los Dres. Daniel Finley y Steven Gygi. Durante este tiempo continuó especializándose en diversos métodos de proteómica cuantitativa para el estudio del sistema ubiquitina proteasoma (UPS) y su implicación en el remodelado del proteoma que tiene lugar en diversos procesos neurodegenerativos o de diferenciación terminal.

En 2019, se convirtió en el líder del equipo de proteómica cuantitativa del “Proteostasis Consortium”, consorcio americano dedicado al estudio del envejecimiento y las enfermedades neurodegenerativas.

En 2022, el Dr. Prado se estableció como investigador independiente y líder del grupo de Proteómica y Proteostasis del ISPA (Asturias) gracias a la ayuda Miguel Servet para la estabilización y consolidación de investigadores.

Durante su carrera investigadora (a marzo de 2024), el Dr. Prado a publicado 27 artículos científicos y participado en más de 15 proyectos nacionales e internacionales financiados por diversas agencias (Ministerio de Ciencia e Innovación, NIH, Fundación target ALS, Fundación Rainwater Charitable, Fundación Michael J. Fox, etc).

 

 

Laboratorio N-1, F-1.41
Edificio ISPA-FINBA
Avda. Hospital Universitario s/n
33011 Oviedo

Correo electrónico: miguel.prado@ispasturias.es

Teléfono: 985101078

Twitter: MAPrado_MS

Linkedin: Miguel A. Prado

Nombre Institución Clasificación Euraxess
Maeso Miguel, Daniel FINBA R2
Martínez Botía, Patricia FINBA R2
Prado Rodríguez, Miguel Ángel FINBA R4
Tejedor Agustiño, Abraham FINBA R1

 

Cómo se formó

El laboratorio de Proteómica y Proteostasis abrió oficialmente sus puertas en Julio de 2022 tras el retorno del Investigador Principal a España después de más de 10 años como investigador postdoctoral en Harvard Medical School (EEUU). Este retorno pudo llevarse a cabo con a una ayuda Miguel Servet del Instituto de Salud Carlos III.

 

Prioridades actuales y futuras

El objetivo principal del grupo es estudiar la homeostasis proteica y su implicación en diversos procesos como el envejecimiento, la diferenciación terminal y en el desarrollo de múltiples enfermedades, incluida la neurodegeneración. Para ello, se formará un equipo de investigadores multidisciplinar que incluya biólogos moleculares, químicos, bioquímicos, bioinformáticos y biólogos estructurales, que permitirá utilizar un enfoque integral desde múltiples perspectivas para el estudio de los procesos indicados.

La línea principal de investigación del laboratorio de Proteómica y proteostasis se centra en el estudio de la homeostasis proteica (proteostasis) y como esta se mantiene remodelándose la composición, abundancia y modificaciones postraduccionales del proteoma celular bajo determinados estímulos y condiciones. Este remodelado del proteoma ligado al mantenimiento de la homeostasis proteica será estudiado en:

  • El desarrollo y la diferenciación terminal.
  • El trascurso y desarrollo de determinadas patologías, incluyendo la neurodegeneración u otras enfermedades relacionadas con el envejecimiento.
  • La respuesta a determinadas condiciones de estrés donde se vean afectados procesos cruciales como plegamiento, ensamblado, tráfico y degradación de las proteínas (incluyendo el sistema ubiquitina proteasoma) que componen el proteoma celular.

Para la caracterización de estos procesos se utilizarán técnicas vanguardistas en proteómica cuantitativa basadas en espectrometría de masas. Estos métodos permiten el análisis de mezclas proteicas complejas, así como sus modificaciones postraduccionales (fosforilación, ubiquitinación, acetilación, etc), de una manera global y cuantitativa.

  • Luo Q, Raulston EG, Prado MA, Wu X, Gritsman K, Yan K, Booth CAG, Xu R, van Galen P, Doench JG, Shimony S, Long HW, Neuberg DS, Paulo JA, Lane AA. Targetable leukemia dependency on noncanonical PI3Kγ signaling. bioRxiv [Preprint]. 2023 Dec 15:2023.12.15.571909. doi: 10.1101/2023.12.15.571909. Update in: Nature. 2024 Jun;630(8015):198-205. doi: 10.1038/s41586-024-07410-3. PMID: 38328043; PMCID: PMC10849582.
  • F. Ebstein, X. Latypova, K.Y.S. Hung, M.A. Prado, B-H. Lee, S. Möller, M. Wendlandt, B.A. Zieba, L. Florenceau, V. Vignard , L. Poirier, B. Toutain, I. Moroni, C. Dubucs, N. Chassaing, J. Horvath, H. Prokisch, S. Küry, S. Bézieau, J.A. Paulo, D. Finley, E. Krüger, D. Ghezzi, B. Isidor. Biallelic USP14 variants cause a syndromic neurodevelopmental disorder. Genetics in Medicine. 2024. PMID: 38469793. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1016/j.gim.2024.101120
  • X. Han, Y. Mei, R.K. Mishra, H. Bi, A.D. Jain, G.E. Schiltz, B. Zhao, M. Sukhanova, P. Wang, A.A. Grigorescu, P.C. Weber, J.J. Piwinski, M.A. Prado, J.A Paulo, L. Stephens, K.E. Anderson, C.S. Abrams, J. Yang, P. Ji. Targeting pleckstrin-2/Akt signaling reduces proliferation in myeloproliferative neoplasm models. The Journal of Clinical Investigation. 2023. PMID: 36719747. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1172/jci159638
  • H.A.B. Paterson*, S. Yu*, N. Artigas, M.A. Prado, N. Haberman, Y. Wang, A.M. Jobbins, E. Pahita, J. Mokochinski, Z. Hall, M. Guerin, J.A. Paulo, S.S. Ng, F. Villarroya, S. Tamir Rashid, W. Le Goff, B. Lenhard, I. Cebola, D. Finley, S.P. Gygi, C.R. Sibley, S. Vernia. Liver RBFOX2 regulates cholesterol homeostasis via Scarb1 alternative splicing in mice. Nature Metabolism. 2022. PMID: 36536133. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1038/s42255-022-00681-y
    * Equal contribution.
  • B.C. Lin, T.H. Phung, N.R. Higgins, J.E. Greenslade, M.A. Prado, D. Finley, M. Karbowski, B.M. Polster, M.J. Monteiro. ALS/FTD mutations in UBQLN2 are linked to mitochondrial dysfunction through loss-of-function in mitochondrial protein import. Human Molecular Genetics. 2021. PMID: 33891006. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1093/hmg/ddab116
  • H.M. Schnell, R.M. Walsh Jr., S. Rawson, M. Kaur, M.K. Bhanu, G. Tian, M.A. Prado, A. Guerra-Moreno, J.A. Paulo, S.P. Gygi, J. Roelofs, D. Finley, J. Hanna. Structures of chaperone-associated assembly intermediates reveal coordinated mechanisms of proteasome biogenesis. Nature structural & molecular biology. 2021. PMID: 33846632. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1038/s41594-021-00583-9
  • C. Cao, M.A. Prado, L. Sun, S. Rockowitz, P. Sliz, J.A. Paulo, D. Finley, M.D. Fleming. Maternal Iron Deficiency Modulates Placental Transcriptome and Proteome in Mid-Gestation of Mouse Pregnancy. The Journal of Nutrition. 2021. PMID: 33693820. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1093/jn/nxab005
  • Y. Liu, Y. Mei, F.V. Korobova, M.A. Prado, J. Yang, Z. Peng, J. Paulo, S. Gygi, D. Finley, P. Ji. Membrane skeleton modulates erythroid proteome remodeling and organelle clearance. Blood. 2021. PMID: 33036023. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1182/blood.2020006673
  • A.M. Whiteley*, M.A. Prado*, S.A.H. de Poot, J.A. Paulo, M. Ashton, S. Dominguez, M. Weber, H. Ngu, J. Szpyt, M.P. Jedrychowski, A. Easton, S.P. Gygi, T Kurz, MJ Monteiro, EJ Brown, D Finley. Global proteomics of Ubqln2-based murine models of ALS. Journal of Biological Chemistry. 2021. PMID: 33277362. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1074/jbc.ra120.015960
    * Equal contribution.
  • J.J. Wu, A. Cai, J.E. Greenslade, N.R. Higgins, C. Fan, N.T.T. Le, M. Tatman, A.M. Whiteley, M.A. Prado, B.V. Dieriks, M.A. Curtis, C.E. Shaw, T. Siddique, R.L.M. Faull, E.L. Scotter, D. Finley, M.J. Monteiro. ALS/FTD mutations in UBQLN2 impede autophagy by reducing autophagosome acidification through loss of function. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2020. PMID: 32513711. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1073/pnas.1917371117
  • L. Cabal-Hierro, P. van Galen, M.A. Prado, K.J. Higby, K. Togami, C.T. Mowery, J.A. Paulo, Y. Xie, P. Cejas, T. Furusawa, M. Bustin, H.W. Long, D.B. Sykes, S.P. Gygi, D. Finley, B.E. Bernstein, A.A. Lane. Chromatin accessibility promotes hematopoietic and leukemia stem cell activity. Nature Communications. 2020. PMID: 32179749. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1038/s41467-020-15221-z
  • D. Finley, M.A. Prado. The Proteasome and Its Network: Engineering for Adaptability. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2020. PMID: 30833452. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1101/cshperspect.a033985
  • A. Guerra-Moreno, M.A. Prado, J. Ang, H. Schnell, Y. Micoogullari, J.A. Paulo, D. Finley, S.P. Gygi, J. Hanna. Thiol-based direct threat sensing by the stress-activated protein kinase Hog1. Science Signaling. 2019. PMID: 31772124. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1126/scisignal.aaw4956
  • F. Massa, R. Tammaro, M.A. Prado, M. Cesana, B.H. Lee, D. Finley, B. Franco, M. Morleo. The deubiquitinating enzyme USP14 controls ciliogenesis and hedgehog signalling. Human Molecular Genetics. 2019. PMID: 30388222. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1093/hmg/ddy380
  • G. Bretones, M.G. Alvarez, J.R. Arango, D. Rodriguez, F. Nadeu, M.A. Prado, R. Valdes-Mas, D.A. Puente, J.A. Paulo, J. Delgado, N. Villamor, A. Lopez-Guillermo, D.J. Finley, S.P. Gygi, E. Campo, V. Quesada, C. Lopez-Otin. Altered patterns of global protein synthesis and translational fidelity in RPS15-mutated chronic lymphocytic leukemia. Blood. 2018. PMID: 30181176. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1182/blood-2017-09-804401
  • M. Boselli*, B.H. Lee*, J. Robert, M.A. Prado, S.W. Min, C.L. Cheng, M.C. Silvia, C. Seong, S. Elsasser, K.M. Hatle, T.C. Gahman, S.P. Gygi, S.J. Haggarty, L. Gan, R.W. King, D. Finley. An inhibitor of the proteasomal deubiquitinating enzyme USP14 induces tau elimination in cultured neurons. Journal of Biological Chemistry. 2017. PMID: 28972160. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1074/jbc.m117.815126
    * Equal contribution.
  • A.T. Nguyen*, M.A. Prado*, P.J. Schmidt, A.K. Sendamarai, J.T. Wilson-Grady, M. Min, D.R. Campagna, G. Tian, Y. Shi, V. Dederer, M. Kawan, N. Kuehnle, J.A. Paulo, Y. Yao, M.J. Weiss, M.J. Justice, S.P. Gygi, M.D. Fleming, D. Finley. UBE2O remodels the proteome during terminal erythroid differentiation. Science. 2017. PMID: 28774900. https://doi-org.ezp-prod1.hul.harvard.edu/10.1126/science.aan0218
    * Equal contribution.
  • Proteome remodeling in terminal erythropoiesis
    Investigador principal: M. A. Prado
    Organismo financiador: Spanish Ministry of Science and Innovation, Proyectos de Generación del Conocimiento 2022
    Duración: 2023-2026
    Cuantía: 275.000 €.

 

  • Proteome remodeling and quantitative proteomics
    Investigador principal: M. A. Prado
    Organismo financiador: National Institute of Health Carlos III (ISCIII), Miguel Servet 2021
    Duración: 2022-2027
    Cuantía: 308.600 €.