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Genómica, cáncer y envejecimiento

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José María Pérez Freije

El Dr. Pérez Freije es investigador del grupo de Genómica, cáncer y envejecimiento del ISPA, y desde junio de 2020 coordina el Área transversal de Investigación en Envejecimiento

Investigador responsable hasta diciembre de 2023
Dr. Carlos López Otín

Carlos López Otín es profesor del departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad de Oviedo, donde combina sus responsabilidades docentes con sus líneas de investigación en Cáncer y Biología del envejecimiento, así como el Análisis funcional de genomas.

Su trabajo ha generado más de 400 artículos en publicaciones de impacto internacional y han sido citados más de 44000 veces, con un índice Hirsch agregado de h=100.

Es miembro del consejo editorial de numerosas revistas científicas, comités y sociedades científicas, incluyendo la Real Academia de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales y la Academia Europæa.

A lo largo de su carrera científica ha recibido diferentes galardones y distinciones nacionales e internacionales, como el doctorado honoris causa por la Universidad Menéndez Pelayo y la Universidad de Zaragoza, el premio Rey Jaime I de Investigación Básica, el Premio del 25 aniversario de la FEBS en Bioquímica, el Premio México de Ciencia y Tecnología y el Premio Nacional de Investigación Santiago Ramón y Cajal.

Fernando Bongera s/n, 33006 Oviedo

Teléfono: 985104201

Email: clo@uniovi.es

Página web

Nombre Institución Clasificación Euraxess
Álvarez Puente, Diana Universidad de Oviedo Sin clasificación
Gutiérrez Fernández, Ana Universidad de Oviedo R3
López Soto, Alejandro Universidad de Oviedo R2
López Tamargo, Sara Universidad de Oviedo R1
Moral Quirós, Pedro FINBA R3
Pérez Freije, Jose María Universidad de Oviedo R4
Quesada Fernández, Víctor Universidad de Oviedo R3
Rodríguez Folgueras, Alicia Universidad de Oviedo R2
Suárez Puente, Xose Antón Universidad de Oviedo R3
Degradómica

Poco después de su llegada a la Universidad de Oviedo hace más de 30 años, Carlos López Otín concentró sus esfuerzos en el papel de los sistemas proteolíticos en procesos patológicos, incluyendo los devastadores síndromes de envejecimiento acelerado. El grupo ha propuesto la aplicación de un enfoque global al estudio de las proteasas en la salud y la enfermedad, a través de conceptos novedosos como la Degradómica y el Degradoma, junto con el desarrollo (en colaboración con Chris Overall) de métodos de alto rendimiento que abordan dichos conceptos. En estudios paralelos, el grupo de López Otín ha estado involucrado en la anotación funcional del genoma humano y de otros genomas y degradomas de relevancia evolutiva, desde chimpancés y otros primates hasta ratones y ballenas.

Genómica del cáncer

Desde 2009, Carlos López Otín codirige la contribución española al Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer (ICGC-CLL). Este trabajo científico ha llevado a revelar la secuencia del genoma completo de tumores de cientos de pacientes con leucemia linfocítica crónica y a la identificación de mutaciones recurrentes en varios genes, que se han convertido en objetivos prioritarios para la intervención terapéutica en esta frecuente neoplasia. El trabajo del laboratorio de López Otín en oncología molecular también ha conducido al descubrimiento de varias proteasas con paradójica acción antitumoral y antimetastática, así como de dos nuevos genes implicados en la progresión de carcinomas de cabeza y cuello. Fuertemente vinculado a los proyectos de Genoma del cáncer, el grupo de López Otín ha identificado los determinantes genéticos de varias enfermedades hereditarias. Entre estos estudios destaca el descubrimiento de dos novedosos síndromes de envejecimiento prematuro, el síndrome de progeria de Néstor-Guillermo (NGPS) y el de progeria atípica neonatal (ANPS). Su trabajo también ha permitido el hallazgo de genes causantes de muerte súbita hereditaria, anemia microcítica, anormalidades óseas y melanoma familiar. Estos estudios genómicos han representado la base para la creación de un programa de Genómica Social por López Otín, que ha permitido estudiar y en algunos casos revelar las bases genómicas de enfermedades hereditarias de familias que acuden a su laboratorio en busca de ayuda, salud y conocimiento.

Envejecimiento

El trabajo del grupo de López Otín en la Universidad de Oviedo también ha contribuido a clarificar los mecanismos moleculares asociados con el envejecimiento fisiológico y sus vínculos con el cáncer. Así mismo han informado del primer análisis integral de puntos clave del envejecimiento a nivel molecular y celular, y propuesto diferentes estrategias para el control metabólico de la longevidad. Además, recientemente han desarrollado un método para facilitar la reprogramación celular de células humanas envejecidas a células pluripotenciales con propiedades embrionarias. El grupo de López Otín ha descrito la pérdida del mecanismo regulador de la proteostasis en la transformación mieloide, conectando alteraciones de células madre hematopoyéticas asociadas con la edad con la patogénesis de enfermedades hematológicas. Finalmente, han revelado los mecanismos moleculares subyacentes a diferentes síndromes de envejecimiento prematuro y, en colaboración con el grupo de Nicolas Levy, han desarrollado estrategias terapéuticas para el tratamiento del síndrome de progeria de Hutchinson-Gilford (HGPS).

  1. AUTORES: Ferrando, A. A. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Clonal evolution in leukemia. Nature Med, 23, 1135-1145 (2017).
    de la Rosa, J., Weber, J., Friedrich, M. J., Li, Y., Rad, L., Ponstingl, H., Liang, Q., de Quiros, S. B., Noorani, I., Metzakopian, E., Strong, A., Li, M. A., Astudillo, A., Fernandez-Garcia, M. T., Fernandez-Garcia, M. S., Hoffman, G. J., Fuente, R., Vassiliou, G. S., Rad, R., Lopez-Otin, C., Bradley, A. and Cadinanos, J.
    TÍTULO: A single-copy Sleeping Beauty transposon mutagenesis screen identifies new PTEN-cooperating tumor suppressor genes. Nature Genet, 49, 730-741 (2017).
  2. AUTORES: Lopez-Otin, C., Galluzzi, L., Freije, J. M., Madeo, F. and Kroemer, G.
    TÍTULO: Metabolic Control of Longevity. Cell, 166, 802-21 (2016).
  3. AUTORES: Osorio, F. G., Soria-Valles, C., Santiago-Fernandez, O., Bernal, T., Mittelbrunn, M., Colado, E., Rodriguez, F., Bonzon-Kulichenko, E., Vazquez, J., Porta-de-la-Riva, M., Ceron, J., Fueyo, A., Li, J., Green, A. R., Freije, J. M. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Loss of the proteostasis factor AIRAPL causes myeloid transformation by deregulating IGF-1 signaling. Nature Med, 22, 91-6 (2016).
  4. AUTORES: Puente, X. S., et al.
    TÍTULO: Non-coding recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia. Nature, 526, 519-24 (2015).
  5. AUTORES: Soria-Valles, C., Osorio, F. G., Gutierrez-Fernandez, A., De Los Angeles, A., Bueno, C., Menendez, P., Martin-Subero, J. I., Daley, G. Q., Freije, J. M. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: NF-kappaB activation impairs somatic cell reprogramming in ageing. Nature Cell Biol, 17, 1004-13 (2015).
  6. AUTORES: Quiros, P. M., Langer, T. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: New roles for mitochondrial proteases in health, ageing and disease. Nature Rev Mol Cell Biol, 16, 345-59 (2015).
  7. AUTORES: Robles-Espinoza, C. D.,et al.
    TÍTULO: POT1 loss-of-function variants predispose to familial melanoma. Nature Genet, 46, 478-81 (2014).
  8. AUTORES: Gordon, L. B., Rothman, F. G., Lopez-Otin, C. and Misteli, T.
    TÍTULO: Progeria: a paradigm for translational medicine. Cell, 156, 400-7 (2014).
  9. AUTORES:
    TÍTULO: Marmoset Genome Sequencing and Analysis Consortium. The common marmoset genome provides insight into primate biology and evolution. Nature Genet, 46, 850-7 (2014).
  10. AUTORES: Fanjul-Fernandez, M., Quesada, V., Cabanillas, R., Cadinanos, J., Fontanil, T., Obaya, A., Ramsay, A. J., Llorente, J. L., Astudillo, A., Cal, S. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Cell-cell adhesion genes CTNNA2 and CTNNA3 are tumour suppressors frequently mutated in laryngeal carcinomas. Nature Commun, 4, 2531 (2013).
  11. AUTORES: Alexandrov, L. B., et al.
    TÍTULO: Signatures of mutational processes in human cancer. Nature, 500, 415-21 (2013).
  12. AUTORES: de la Rosa, J., Freije, J. M., Cabanillas, R., Osorio, F. G., Fraga, M. F., Fernandez-Garcia, M. S., Rad, R., Fanjul, V., Ugalde, A. P., Liang, Q., Prosser, H. M., Bradley, A., Cadinanos, J. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Prelamin A causes progeria through cell-extrinsic mechanisms and prevents cancer invasion. Nature Commun, 4, 2268 (2013).
  13. AUTORES: Lapuente-Brun, E., Moreno-Loshuertos, R., Acin-Perez, R., Latorre-Pellicer, A., Colas, C., Balsa, E., Perales-Clemente, E., Quiros, P. M., Calvo, E., Rodriguez-Hernandez, M. A., Navas, P., Cruz, R., Carracedo, A., Lopez-Otin, C., Perez-Martos, A., Fernandez-Silva, P., Fernandez-Vizarra, E. and Enriquez, J. A.
    TÍTULO: Supercomplex assembly determines electron flux in the mitochondrial electron transport chain. Science, 340, 1567-70 (2013).
  14. AUTORES: Lopez-Otin, C., Blasco, M. A., Partridge, L., Serrano, M. and Kroemer, G.
    TÍTULO: The hallmarks of aging. Cell, 153, 1194-217 (2013).
  15. AUTORES: Ramsay, A. J., Quesada, V., Foronda, M., Conde, L., Martinez-Trillos, A., Villamor, N., Rodriguez, D., Kwarciak, A., Garabaya, C., Gallardo, M., Lopez-Guerra, M., Lopez-Guillermo, A., Puente, X. S., Blasco, M. A., Campo, E. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: POT1 mutations cause telomere dysfunction in chronic lymphocytic leukemia. Nature Genet, 45, 526-30 (2013).
  16. AUTORES: Puente, X. S. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: The evolutionary biography of chronic lymphocytic leukemia. Nature Genet, 45, 229-31 (2013).
  17. AUTORES: Quesada, V., et al.
    TÍTULO: Exome sequencing identifies recurrent mutations of the splicing factor SF3B1 gene in chronic lymphocytic leukemia. Nature Genet, 44, 47-52 (2012).
  18. AUTORES: Puente, X. S., et al.
    TÍTULO: Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia. Nature, 475, 101-5 (2011).
  19. AUTORES: Puente, X. S., Quesada, V., Osorio, F. G., Cabanillas, R., Cadinanos, J., Fraile, J. M., Ordonez, G. R., Puente, D. A., Gutierrez-Fernandez, A., Fanjul-Fernandez, M., Levy, N., Freije, J. M. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Exome sequencing and functional analysis identifies BANF1 mutation as the cause of a hereditary progeroid syndrome. Am J Hum Genet, 88, 650-6 (2011).
  20. AUTORES: Locke, D. P., et al.
    TÍTULO: Comparative and demographic analysis of orang-utan genomes. Nature, 469, 529-33 (2011).
  21. AUTORES: Warren, W. C., et al.
    TÍTULO: The genome of a songbird. Nature, 464, 757-62 (2010).
  22. AUTORES: Lopez-Otin, C. and Hunter, T.
    TÍTULO: The regulatory crosstalk between kinases and proteases in cancer. Nature Rev Cancer, 10, 278-92 (2010).
  23. AUTORES:
    TÍTULO: International Cancer Genome Consortium. International network of cancer genome projects. Nature, 464, 993-8 (2010).
  24. AUTORES: Quesada, V., Ordonez, G. R., Sanchez, L. M., Puente, X. S. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: The Degradome database: mammalian proteases and diseases of proteolysis. Nucleic Acids Res, 37, D239-43 (2009).
  25. AUTORES: Varela, I., Pereira, S., Ugalde, A. P., Navarro, C. L., Suarez, M. F., Cau, P., Cadinanos, J., Osorio, F. G., Foray, N., Cobo, J., de Carlos, F., Levy, N., Freije, J. M. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Combined treatment with statins and aminobisphosphonates extends longevity in a mouse model of human premature aging. Nature Med, 14, 767-72 (2008).
  26. AUTORES: Warren, W. C., et al.
    TÍTULO: Genome analysis of the platypus reveals unique signatures of evolution. Nature, 453, 175-83 (2008).
  27. AUTORES: Espada, J., Varela, I., Flores, I., Ugalde, A. P., Cadinanos, J., Pendas, A. M., Stewart, C. L., Tryggvason, K., Blasco, M. A., Freije, J. M. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Nuclear envelope defects cause stem cell dysfunction in premature-aging mice. J Cell Biol, 181, 27-35 (2008).
  28. AUTORES: Lopez-Otin, C. and Bond, J. S.
    TÍTULO: Proteases: multifunctional enzymes in life and disease. J Biol Chem, 283, 30433-7 (2008).
  29. AUTORES: Lopez-Otin, C. and Matrisian, L. M.
    TÍTULO: Emerging roles of proteases in tumour suppression. Nature Rev Cancer, 7, 800-8 (2007).
  30. AUTORES: Marino, G., Salvador-Montoliu, N., Fueyo, A., Knecht, E., Mizushima, N. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Tissue-specific autophagy alterations and increased tumorigenesis in mice deficient in Atg4C/autophagin-3. J Biol Chem, 282, 18573-83 (2007).
  31. AUTORES: Liu, B., Wang, J., Chan, K. M., Tjia, W. M., Deng, W., Guan, X., Huang, J. D., Li, K. M., Chau, P. Y., Chen, D. J., Pei, D., Pendas, A. M., Cadinanos, J., Lopez-Otin, C., Tse, H. F., Hutchison, C., Chen, J., Cao, Y., Cheah, K. S., Tryggvason, K. and Zhou, Z.
    TÍTULO: Genomic instability in laminopathy-based premature aging. Nature Med, 11, 780-5 (2005).
  32. AUTORES:
    TÍTULO: Chimpanzee Sequencing and Analysis Consortium. Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome. Nature, 437, 69-87 (2005).
  33. AUTORES:
    TÍTULO: Rat Genome Sequencing Project Consortium. Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution. Nature, 428, 493-521 (2004).
  34. AUTORES: Balbin, M., Fueyo, A., Tester, A. M., Pendas, A. M., Pitiot, A. S., Astudillo, A., Overall, C. M., Shapiro, S. D. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Loss of collagenase-2 confers increased skin tumor susceptibility to male mice. Nature Genet, 35, 252-7 (2003).
  35. AUTORES: Puente, X. S., Sanchez, L. M., Overall, C. M. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Human and mouse proteases: a comparative genomic approach. Nature Rev Genet, 4, 544-58 (2003).
  36. AUTORES: Cal, S., Quesada, V., Garabaya, C. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Polyserase-I, a human polyprotease with the ability to generate independent serine protease domains from a single translation product. Proc Natl Acad Sci U S A, 100, 9185-90 (2003).
  37. AUTORES: Pendas, A. M., Zhou, Z., Cadinanos, J., Freije, J. M., Wang, J., Hultenby, K., Astudillo, A., Wernerson, A., Rodriguez, F., Tryggvason, K. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Defective prelamin A processing and muscular and adipocyte alterations in Zmpste24 metalloproteinase-deficient mice. Nature Genet, 31, 94-9 (2002).
  38. AUTORES: Lopez-Otin, C. and Overall, C. M.
    TÍTULO: Protease degradomics: a new challenge for proteomics. Nature Rev Mol Cell Biol, 3, 509-19 (2002).
  39. AUTORES: Overall, C. M. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Strategies for MMP inhibition in cancer: innovations for the post-trial era. Nature Rev Cancer, 2, 657-72 (2002).
  40. AUTORES: Freije, J. M., Diez-Itza, I., Balbin, M., Sanchez, L. M., Blasco, R., Tolivia, J. and Lopez-Otin, C.
    TÍTULO: Molecular cloning and expression of collagenase-3, a novel human matrix metalloproteinase produced by breast carcinomas. J Biol Chem, 269, 16766-73 (1994).

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